Sinopsis: Pelicula que cubre el final de la historia de Sidonia no Kishi. Una vez más frente a la amenaza de extinción, se logró una victoria temporal contra los Gauna gracias al híbrido humano-Gauna Tsumugi Shiraui y al piloto de mech Guardian Nagate Tanikaze. 10 años después... La gente de Sidonia disfruta de un breve respiro. Pasan días tranquilos, durante los cuales Tsumugi comienza a darse cuenta de sus sentimientos por Nagate, quien ahora es celebrada como una heroína de Sidonia. Sin embargo, como el Capitán Kobayashi siempre ha sabido, mientras los Gauna permanezcan, la paz no puede durar. La decisión está tomada, una batalla final, sobre la cual descansa el destino de los últimos supervivientes de la humanidad. A medida que se acerca el final, ¿podrá la tripulación proteger a sus seres queridos?